หน่วยการพิมพ์ของเครื่องพิมพ์เฟล็กโซแบบเรียงซ้อนถูกเรียงซ้อนกันขึ้นและลง จัดเรียงบนด้านใดด้านหนึ่งของแผงผนังหลักของชิ้นส่วนที่พิมพ์ กลุ่มสีการพิมพ์แต่ละกลุ่มจะถูกขับเคลื่อนด้วยเฟืองที่ติดตั้งบนแผงผนังหลัก เมื่อพิมพ์ วัสดุพิมพ์จะผ่านแต่ละหน่วยสีที่พิมพ์ตามลำดับ ดำเนินการพิมพ์ทั้งหมดให้เสร็จสิ้น กลุ่มสีการพิมพ์แต่ละกลุ่มมีกระบอกพิมพ์ กระบอกเพลท และอุปกรณ์หมึก และโครงสร้างของกลุ่มสีการพิมพ์แต่ละกลุ่มจะเหมือนกัน เครื่องพิมพ์เฟล็กโซกราฟีแบบเรียงซ้อนสามารถพิมพ์ได้ 1-8 สี แต่ส่วนใหญ่จะพิมพ์ได้ 6 สี หากติดตั้งอุปกรณ์ถอยหลัง ก็สามารถพิมพ์ได้ทั้งสองด้านเช่นกัน